Plik JPK V7K składa się z dwóch części: ewidencyjnej i deklaracji VAT. Pierwsza część, czyli ewidencja VAT, zawiera szczegóły transakcji sprzedaży i zakupów, w tym dane kontrahentów, numery faktur i kwoty netto oraz wysokość VAT. Druga część, czyli deklaracja VAT, uwzględnia podsumowanie rozliczeń podatkowych za dany kwartał, a więc podatek należny, podatek naliczony, kwotę do zapłaty lub do zwrotu. Struktura JPK V7K jest identyczna jak w przypadku JPK V7M, z tą różnicą, że dotyczy okresu kwartalnego zamiast miesięcznego.